为了节省服务器资源和优化BLAST数据库，服务器上的公共目录 /B313/public_db/blast 下构建了三个方便日常使用的BLAST数据库：

1. 鱼类蛋白质数据库（fish_prot)。这个数据库经过我3次优化，之前是我自己在用，效果还不错，比直接使用nr数据库比对高效很多，可以依据实验目的酌情使用。具体所含哪些鱼类的蛋白质序列见 /B313/public_db/blast/README.txt 文档。使用参数 -db fish_prot 来指明这个数据库
2. nr数据库，使用参数 -db nr 来指明这个数据库
3. nt数据库，使用参数 -db nt 来指明这个数据库

最后更新时间

2019.3.17

配置方法

每个用户第一次使用时要先配置一下，以后就可以直接使用。在自己的主目录下：

vi ~/.ncbirc

然后将下面这段文字复制到 ~/.ncbirc

; start the section for BLAST configuration

[BLAST]

; Specifies the path where BLAST databases are installed

BLASTDB=/B313/public_db/blast

; end of file

配置完成，通过 -db 参数指明对应的数据库，如：-db fish_prot。